Comodo Uninstaller – mali alat za uklanjanje Comodo antivirusnih. Softver je koristan u slučajevima kada tradicionalne Windows metode ne uspijevaju potpuno deinstalirati Comodo Antivirus, Comodo Internet Security ili Comodo Firewall. Comodo Uninstaller pomaže u uklanjanju svih ostataka sigurnosnih proizvoda iz sustava, uključujući unose u registar, datoteke, upravljačke programe i podatke za pokretanje. Softver pokreće postupak skeniranja kako bi otkrio datoteke povezane s antivirusom i uklonio sve otkrivene ostatke. Nakon čišćenja sustava, Comodo Uninstaller zahtijeva ponovno pokretanje računala kako bi dovršio uklanjanje.